ד"ר שגיא עוסק ברפואה אסתטית ומתמחה ברפואה פונקציונלית, משתתף בכנסים רבים, הרצאות וסדנאות בארץ ובעולם.
בנוסף מנהל מכינה קדם רפואית ומרצה בתחום האנטומיה, פיזיולוגיה, פתופיזיולוגיה, ביולוגיה, אורח חיים, בריאות וחולי.

מתוך האני מאמין של ד"ר תום שגיא:
"אורח החיים שלנו בנוי מרבדים רבים, כל מטופלת ומטופל הוא עולם ומלואו ויש לבחון את מכלול המרכיבים אשר בונים אותו.
הצורה שבה הגוף מתפקד היא נגזרת ישירה של אורח החיים ולכן, רפואה מניעתית, חינוך ויצירת מודעת הן חלק בלתי נפרד מהטיפול בכל מטופל ומטופלת.
הרפואה של ימינו בנויה על מנת לאתר את מקור הבעיה ולטפל ישירות בסימפטומים ובגורם המחולל.
דרך זו יעילה בהרבה מהמקרים בעקבות מהירותה וזמינותה.
חרף יתרונותיה של הרפואה המודרנית נוצר מחסור אשר הולך וגדל בתקשורת בין הרופא למטופל.
בעקבות מחסור זה, ישנה נטייה לא לקחת בחשבון את המעטפת העוטפת את האדם.
כאשר לא לוקחים את המעטפת האנושית בחשבון אנו כרופאים עלולים לפספס היבטים חשובים אשר משליכים ובונים את המטופל.
המציאות לפעמים כופה עלינו להתמודד עם אילוצים.
החיים בחברה מערבית מודרנית גובה מחיר יקר מהמאזן הבריאותי שלנו, מעלה רמות מתח, לחץ וחרדה ומאלץ אותנו להזניח את הגוף ואת הנפש.
הדבר בא לידי ביטוי באופן סומטי (גופני). כאבי שרירים, כאבי גב כרוניים, דלקות מפרקים, אי סדירות במערכת העיכול, כאבי ראש והזדקנות מואצת של עור הפנים הם רק חלק קטן מהנזקים אותם אנחנו חווים כתוצאה משגרת חיים לקויה.
המטרה האולטימטיבית היא להעניק כלים וידע לשמירה על גוף בריא ואורח חיים מאוזן בנוסף לשיפור התדמית החזותית והעצמת הנפש."